软件概览
SSO Studio 是一款面向实验室和缺少编程背景的临床研究人员的一站式空间组学“可视化分析软件”。
无需编写任何代码，您可以在直观的图形界面中轻松导入多种主流数据格式（如 H5AD, Bassfish, Visium, Xenium），完成从数据预处理到高级空间分析的全流程。
核心优势
- 零代码：专为无编程背景研究人员设计的图形化一站式分析平台
- 广兼容：支持多种主流空间组学数据格式，无缝对接现有管线
- 强集成：集成 Squidpy, Cell2location, Tangram, Seurat 等多种前沿算法
- 高交互：现代化 Canvas/WebGL 可视化，支持悬停、框选与多窗口联动
- 智能化：内置 DeepSeek 智能体，通过对话辅助参数设置与函数调用
核心功能
探索 SSO Studio 强大的功能集，加速您的研究工作
数据兼容与导入
支持多种通用数据格式，包括 H5AD、Bassfish、Visium 和 Xenium，轻松开始您的分析。
核心分析模块
提供从质量控制、标准化、降维（PCA/UMAP）到聚类的完整核心分析流程。
高级空间分析
集成多种主流算法，如用 Squidpy 进行空间邻域分析，用 Cell2location 进行细胞类型去卷积。
跨生态算法集成
打通 Python 与 R 生态，支持 Seurat 的 RCTD 解卷积和 Label Transfer 等功能。
交互式可视化
基于 Canvas/WebGL 的现代化交互，支持悬停高亮、框选、多窗口联动，大数据下依然流畅。
AI 智能体
接入 DeepSeek 智能体，通过自然语言对话，辅助用户进行参数设置和函数调用。
界面导览
了解 SSO Studio 直观、现代化的用户界面
主界面布局
SSO Studio 主界面经过精心设计，旨在提供流畅、直观的零代码分析体验：
- 数据中心 (DataHub)：集中管理导入的数据，轻松切换不同分析项目。
- 功能模块区：集成了从质控、聚类到高级空间分析的全部功能模块。
- 主可视化窗口：基于 Canvas/WebGL 的高性能渲染，支持空间散点图、UMAP 等多种视图。
- 多维联动窗口：多个可视化窗口可实时联动，从不同维度探索数据。
- 参数设置与AI助手：交互式参数调整面板，并内置 DeepSeek 智能体，随时提供帮助。
- 任务状态栏：监控后台多线程任务的实时进度，大数据分析不卡顿。
核心功能区详解
提供标准的空间组学分析流程，包括：
- 质量控制 (QC)
- 数据标准化 (Normalization)
- 降维 (PCA, UMAP)
- 聚类 (Clustering)
集成了多种前沿算法，用于深度空间数据挖掘：
- Squidpy：空间邻域/共现/网络分析
- Cell2location：细胞类型去卷积与空间映射
- Tangram：转录组到空间的深度学习映射
- COMMOT：细胞通讯分析
- SPACEL：空间功能区域识别
打通 R 与 Python 生态，无需切换环境即可调用：
- Seurat RCTD：使用 R Seurat 包进行解卷积
- Seurat Label Transfer：标签传递功能