试剂盒概述
鲈鱼科技自主研发的Bassfish RNA原位检测试剂盒，采用原位杂交技术，可实现对多种RNA分子的高精度空间定位分析
Bassfish RNA原位检测技术整合了样本制备和成像检测两大系统，能够针对mRNA、lncRNA等多种RNA分子进行个性化定制探针设计，实现对组织样本中原位RNA表达的可视化分析。 该技术突破了传统转录组学技术的空间分辨率限制，可在保持组织形态完整性的同时，解析不同细胞群体中基因表达的空间分布特征，为理解复杂生物过程中的基因调控网络提供了强大工具。 应用领域包括但不限于发育生物学、神经科学、肿瘤微环境研究、传染病机理研究和药物疗效评估等。
| 名称 | 试剂盒组成 | 规格 |
|---|---|---|
| 样本制备试剂盒 (Sample Preparation Reagent Kit) |
Sample Preparation Reagent Kit v1.0 module 1 | 4 / 16 rxns |
| Sample Preparation Reagent Kit v1.0 module 2 | ||
| Target gene probes（含阳性对照） |
| 名称 | 试剂盒组成 | 规格 |
|---|---|---|
| 样本成像试剂盒 (Sample Image Kit) |
Sample Preparation Image Kit v1.0 module 1 | 15 / 30 cycles |
| Sample Preparation Image Kit v1.0 module 2 | ||
| Target gene encode probes（含阳性对照） |
| 标准基因Panel | 功能（检测组织中特异细胞类群的分布与基因表达） |
|---|---|
| 小鼠脑103基因Panel | 神经元主要亚型，星形胶质细胞，少突胶质细胞等10+种细胞类型 |
| 小鼠脑305基因Panel | 大类细胞类型与精细神经元分类以及脑区特异性基因等20+种细胞类型 |
| 小鼠肾脏225基因Panel | 肾脏上皮细胞、内皮细胞、免疫细胞、足细胞、髓样细胞等 |
| 人脑298基因Panel | 胶质细胞、肿瘤细胞、免疫细胞、血管细胞、成纤维细胞等 |
核心特点
高分辨率
实现亚细胞级别的空间分辨率，精确定位RNA在细胞和组织中的分布
高灵敏度
可检测低丰度RNA分子，包括mRNA、lncRNA等多种RNA类型
高特异性
特异性探针设计，减少非特异性信号干扰，确保结果准确可靠
多重检测
支持多轮成像检测，可在同一组织中同时分析数十种RNA靶标
产品组成
Bassfish RNA原位检测系统包含样本制备和样本成像两大试剂盒，满足从样本处理到成像分析的全流程需求
样本制备试剂盒
Bassfish Sample Preparation Reagent Kit v1.0
包含模块:
- Module 1: 20X Buffer A, 20X Buffer B
- Module 2: 4% PFA, 10% Buffer T, 10X Buffer C
- Module 3: Reagent R, Reagent I, Reagent A, Reagent B, 10X Reagent A Buffer, 10X Reagent B Buffer, Reagent C, Reagent D, Bassfish Primer, Bassfish Postive Gene Padlock Probe Mix, Bassfish Target Gene Padlock Probe Mix
保存条件:
室温、4℃、-20℃、-80℃多种保存条件
样本成像试剂盒
Bassfish Sample Image Reagent Kit v1.0
包含模块:
- Module 1: 20X Buffer A, 20X Buffer B
- Module 2-1: 10% Buffer T, 10X Buffer B2, Wash buffer C, Image Reagent A, Image Reagent C
- Module 2-2: Image Buffer Mix, Image Reagent B
- Module 3: Image probe系列(470/550/635/740), Bassfish Postive Gene Padlock Probe Mix, Bassfish Target Gene Padlock Probe Mix
保存条件:
室温、4℃、-20℃多种保存条件
实验流程
Bassfish RNA原位检测包含样本制备和成像分析两大阶段，简化实验操作流程
组织前固定
样本复温、4% PFA固定、甲醇固定，保持组织形态完整性
探针杂交
配制缓冲液、探针杂交反应，实现靶标RNA的特异性结合
探针连接
洗涤、连接反应，确保探针稳定结合
引物杂交
配制缓冲液、引物杂交反应，为扩增做准备
滚环扩增
洗涤、滚环扩增反应，放大信号强度
组织后固定与成像
后固定、洗涤、使用成像试剂盒进行检测分析
实验周期
完整的Bassfish检测流程通常需要3-5天，包括样本制备、杂交反应和成像分析等步骤。
多轮成像可根据实验设计灵活调整，每轮成像时间约2-4小时。
自动化流程
MetaScope 2.0系统提供全自动成像流程，减少人工操作，提高实验一致性和可重复性。
系统支持多轮自动切换和图像采集，简化复杂实验操作。